2004年11月，上海同济科技园有限公司出资160万元投资成立上海同杰良生物材料有限公司，该投资占公司注册资本3.97%。

        2005年1月12日，上海同济杨浦科技创业园有限公司董事会同意出资10万元参与组建“上海数字农业工程技术研究中心”，该出资占公司注册资本200万元的5%。

        2005年4月11日，上海同济科技园有限公司出资300万元参与组建“上海市青年科技创业园有限公司”，该出资占公司注册资本1500万元的20%。

        2006年5月，上海同济科技园有限公司投资成立上海南方模式生物材料科技发展有限公司，持股比例6.89%。

        2006年6月1日，同济大学副校长杨东援与中国工程院院士、苏州市副市长徐南平，在苏州古镇木渎签署校、市全面科技合作协议，正式启动“同济大学科技园苏州基地项目”开发，该项目总投资四点五亿元人民币，占地九十一亩。随后，上海同济科技园有限公司投资200万元与苏州有关单位共同成立苏州博济堂科技园投资发展有限公司，具体负责同济科技园苏州基地的开发建设，该出资占公司注册资本2000万元的10%。

        2010年9月，上海同济科技园有限公司出资15万元受让上海优浥网络科技有限公司37.5%的股份，具体负责环同济知识经济圈公共产业服务平台—柔性设计馆的运营管理。